اقبال شناسی کی روایت میں ڈاکٹر محمد رفیع الدین کا مقام نہایت اہم ہے، کیونکہ انہوں نے اقبال کے فلسفیانہ اور فکری مباحث کو نہ صرف گہرائی سے سمجھا بلکہ ان کی توضیح بھی کی۔ ڈاکٹر محمد رفیع الدین نے اقبال کے تصور خودی، نظریہ معرفت، اور اجتہاد جیسے بنیادی فلسفیانہ نکات پر تحقیق کی اور انہیں اسلامی فلسفے اور جدید فکری تناظر میں پیش کیا۔ ان کی کتاب “اسلام اور جدید ذہن کے شبہات” اقبال کے فکری مباحث کو سمجھنے کے لیے ایک بنیادی ماخذ سمجھی جاتی ہے، جس میں انہوں نے مغربی فلسفے کے تناظر میں اقبال کے نظریات کی وضاحت کی۔ وہ اقبال کے فکری ورثے کو محض شعری یا ادبی زاویے سے دیکھنے کے بجائے اسے ایک مربوط فلسفیانہ نظریہ سمجھتے تھے، جس میں روحانی و مابعدالطبیعیاتی عناصر بھی شامل ہیں۔ اقبال کے تصور اجتہاد اور اسلامی نشاۃ ثانیہ کے موضوعات پر ان کی تشریحات نے اقبال شناسی کو ایک نئی علمی جہت دی۔ اس اعتبار سے، ڈاکٹر محمد رفیع الدین کا کام اقبال شناسی کی روایت میں ایک سنگ میل کی حیثیت رکھتا ہے اور ان کے تجزیے آج بھی اقبالی فکر کے سنجیدہ طالب علموں کے لیے رہنمائی فراہم کرتے ہیں۔